Taki habite Tokyo où il partage son temps entre les cours, les amis et un petit boulot alimentaire... Bref: un citadin confirmé ! Un jour, il se retrouve dans le corps de Mitsuha, une jeune fille habitant la campagne, bien entourée, et malgré cette bienveillance elle a l'impression d'étouffer dans sa vie de jeune femme qui lui semble toute tracée: "si seulement elle pouvait être un garçon"... Grâce à ce phénomène étrange où chacun vie la vie de l'autre, les jeunes gens comprennent que l'on peut appréhender la vie autrement et sortir des sentiers battus.