Edward et Alphonse sont deux jeunes garçons vivant à Resembool, un petit village d'Amestris. En voulant ramener leur mère à la vie grâce à l'Alchimie, ils ont perdu des parties de leur corps. Edward, l'aîné, porte des prothèses métallique, des automails, au bras droit et à la jambe gauche, tandis que son cadet, Alphonse, n'est qu'une âme lié à une armure. Pour retrouver leurs corps, les deux frères cherchent la pierre philosophale et se sont engagés dans l'armée pour avoir plus facilement accès aux informations la concernant.