Benvenuti al terz'ultimo appuntamento con MARMALADE BOY e le vicende amorose e famigliari di Miki Koishikawa, dei suoi amici e della sua particolarissima famiglia. Proprio all'inizio della serie, i genitori hanno comunicato a Miki di volersi separare, scambiando i partner con una coppia conosciuta alle Hawaii, per poi convivere tutti insieme in un'unica casa. Il lacerante divorzio degli amati genitori ha portato nella vita di Miki un fratellastro: Yu Matsura, figlio dell'altra coppia, il quale, a differenza di lei, è parso subito a suo agio nella nuova situazione. Pur essendo inizialmente arrabbiata per la convivenza forzata, Miki ha finito per farsi intrigare da Yu, che si è dimostrato sì indisponente e triste (forse per via dei dubbi sul suo vero padre), ma anche affascinante: un ragazzo dolce e amaro come la marmellata di arance! Dopo breve tempo, i due si sono dichiarati, iniziando una storia d'amore osteggiata da molti: dalla modella Suzu Sakuma (che non ritiene Miki adatta a Yu) a Kei Tsuchiya (un pianista deluso che pare aver trovato la forza di vivere grazie alla nostra protagonista). Sullo sfondo della vicenda, l'amore prima negato e poi risbocciato tra la migliore amica di MikiMeiko Akizuki, e il bel professore Shin'ichi "Nacchan" Namura, scacciato dalla scuola proprio per la sua relazione con la liceale.